65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000213 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  66.35 
 
 		 212 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  43.69 
 
 		 245 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  32.12 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  33.96 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  29.73 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  31.91 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  31.84 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  32.87 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  32.04 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3946  hypothetical protein  26.11 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3777  hypothetical protein  26.11 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3767  hypothetical protein  26.11 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3887  hypothetical protein  26.11 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3844  hypothetical protein  26.11 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  31.18 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3872  YhhN family protein  25.38 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  32.75 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  34.38 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  28.57 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2377  hypothetical protein  26.7 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  29.63 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  34.38 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  32.14 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  31.38 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  35.82 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  29.21 
 
 		 626 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  30.26 
 
 		 236 aa  51.6  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3881  YhhN family protein  23.81 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3751  hypothetical protein  26.24 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4788  hypothetical protein  26.24 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0248  YhhN family protein  26.24 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  35.29 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0247  YhhN family protein  26.24 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03270  hypothetical protein  26.24 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3854  hypothetical protein  26.24 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.85502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3950  hypothetical protein  26.24 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  27.81 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03317  conserved inner membrane protein  26.24 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  30.16 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3667  hypothetical protein  25.74 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2729  hypothetical protein  27.61 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000838492  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  29.49 
 
 		 597 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  29.15 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  27.98 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  34.33 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  34.33 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  29.63 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  33.58 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.13 
 
 		 597 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1310  YhhN family protein  27.44 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0457  hypothetical protein  25.43 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4846  hypothetical protein  25.51 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0477  hypothetical protein  26.01 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0089  YhhN family protein  26.7 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0390  hypothetical protein  25.43 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  27.91 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0399  YhhN family protein  24.86 
 
 		 226 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0527  hypothetical protein  24.86 
 
 		 226 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0526  hypothetical protein  24.86 
 
 		 226 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  32.17 
 
 		 253 aa  42  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0387  hypothetical protein  24.86 
 
 		 226 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0399  hypothetical protein  24.86 
 
 		 226 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0412  hypothetical protein  24.86 
 
 		 226 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.758304  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>