56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2193 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  36.08 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  34.62 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  30.46 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  31.94 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  31.34 
 
 		 626 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  32.95 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  34.03 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  30.18 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  31.53 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  29.58 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  31.53 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1449  YhhN family protein  33.53 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  31.03 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  30.77 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  32.99 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  30.32 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  35.8 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  28.44 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  31.72 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  32.59 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  30.91 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  31.79 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  32.75 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  31.25 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  30.65 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  30.52 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  27.01 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  30.99 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  33.8 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  28.74 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  31.74 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  34.51 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0951  YhhN family protein  23.83 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  30.18 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  30.28 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  30.28 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  29.76 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  30.72 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  31.65 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  31.18 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  31.18 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2264  YhhN family protein  25.89 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.410699  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1057  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  30.65 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  28.99 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1642  YhhN family protein  28.3 
 
 		 371 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.450211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  32.16 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  32.16 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  32.16 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  32.16 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  32.16 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  32.16 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  32.16 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2729  hypothetical protein  27.52 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000838492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>