28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1642 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1642  YhhN family protein  100 
 
 
371 aa  722    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.450211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  29.73 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0399  YhhN family protein  30.13 
 
 
226 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  30.36 
 
 
220 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0392  YhhN family protein  33.33 
 
 
226 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0457  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0390  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0387  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0527  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  30.95 
 
 
231 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.758304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0399  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0526  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0477  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  29.56 
 
 
234 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  23.57 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4846  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  27.7 
 
 
220 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  23.93 
 
 
245 aa  49.7  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1449  YhhN family protein  32.41 
 
 
219 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  22.81 
 
 
239 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  24.84 
 
 
214 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  25.55 
 
 
230 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  25.5 
 
 
202 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  25.35 
 
 
236 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  22.7 
 
 
626 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  25.58 
 
 
225 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1310  YhhN family protein  33.06 
 
 
230 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>