46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1010 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  99.54 
 
 
216 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  99.54 
 
 
216 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  99.07 
 
 
216 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  91.2 
 
 
218 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  61.57 
 
 
246 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  62.96 
 
 
246 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  62.96 
 
 
246 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  62.96 
 
 
223 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  62.04 
 
 
223 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  62.04 
 
 
223 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  60.55 
 
 
223 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  44.44 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  43.3 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  43.41 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  44.51 
 
 
253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  42.86 
 
 
254 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  42.41 
 
 
261 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  45.5 
 
 
215 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  44.44 
 
 
252 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  44.44 
 
 
252 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  42.86 
 
 
232 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  45.74 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  31.79 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  46.75 
 
 
626 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  30.35 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  36.84 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  38.38 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  29.65 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  33.5 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  34.56 
 
 
230 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  37.3 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  38.64 
 
 
212 aa  62  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  32.16 
 
 
234 aa  62  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  36.11 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  36.94 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  37.97 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  34.81 
 
 
239 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  39.63 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  29.15 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  37.5 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1916  YhhN-like  34.48 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  40.14 
 
 
202 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>