51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4525 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  100 
 
 		 223 aa  424  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  98.21 
 
 		 223 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  93.27 
 
 		 246 aa  400  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  94.17 
 
 		 246 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  94.17 
 
 		 246 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  94.17 
 
 		 223 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  80.27 
 
 		 223 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  62.5 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  62.5 
 
 		 216 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  62.04 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  62.04 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  62.04 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  62.04 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  62.04 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  62.21 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  39.91 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  43.72 
 
 		 261 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  43.21 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  40.76 
 
 		 254 aa  98.6  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  39.16 
 
 		 254 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  39.13 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  39.02 
 
 		 232 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  39.51 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  39.51 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  39.51 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  35.71 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  39.63 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  40 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  38.37 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5175  YhhN family protein  37.06 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  37.27 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  37.95 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  29.59 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  29.95 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  29.07 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  35.9 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  30.81 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  30.37 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  36.63 
 
 		 626 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  36.6 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  37.5 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  34.91 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2729  hypothetical protein  35.9 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000838492  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  30.57 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  26.24 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  33.58 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  33.71 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1916  YhhN-like  30.99 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10888  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4354  YhhN family protein  35.15 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.856008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  33.09 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  36.09 
 
 		 597 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>