52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3695 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  100 
 
 
246 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  100 
 
 
246 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  94.31 
 
 
246 aa  450  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  98.21 
 
 
223 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  94.17 
 
 
223 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  93.72 
 
 
223 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  80.72 
 
 
223 aa  305  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  63.43 
 
 
216 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  63.43 
 
 
216 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  63.43 
 
 
216 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  62.96 
 
 
216 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  62.96 
 
 
216 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  62.96 
 
 
216 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  62.96 
 
 
216 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  63.13 
 
 
218 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  40.17 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  43.21 
 
 
236 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  42.41 
 
 
254 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  42.41 
 
 
254 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  40.12 
 
 
253 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  42.62 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  39.63 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  37.11 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  40.12 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  40.12 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  40.12 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  39.63 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  40.72 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  38.65 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  37.27 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  41.04 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  29.65 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5175  YhhN family protein  35.29 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  29.08 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  29.8 
 
 
216 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  35.38 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  32.85 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  31.02 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  36.08 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  34.67 
 
 
626 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  34.48 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  34.3 
 
 
214 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  34.94 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  36.94 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  29.26 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4354  YhhN family protein  32.6 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.856008  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1916  YhhN-like  32.07 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10888  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  30.46 
 
 
245 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  38.67 
 
 
597 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  36.25 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2729  hypothetical protein  34.62 
 
 
233 aa  43.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000838492  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  30.6 
 
 
217 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.132681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>