44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3734 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  100 
 
 
232 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  85.65 
 
 
244 aa  314  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  78.67 
 
 
252 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  78.67 
 
 
252 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  78.37 
 
 
215 aa  278  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  60.18 
 
 
261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  51.63 
 
 
253 aa  161  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  50.23 
 
 
254 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  50 
 
 
254 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  43.5 
 
 
228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  43.44 
 
 
236 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  37.61 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  39.02 
 
 
223 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  39.02 
 
 
223 aa  88.6  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  40.33 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  39.78 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  39.78 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  43.03 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  43.03 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  43.03 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  43.03 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  43.03 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  43.03 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  43.03 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  41.15 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  43.62 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  34.09 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  35.54 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  35.29 
 
 
230 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  31.65 
 
 
239 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  29.03 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  27.96 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  28.65 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  38.46 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  31.47 
 
 
221 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  37.59 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  29.13 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  37.69 
 
 
220 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  36.84 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  27.75 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  32.67 
 
 
212 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  32.12 
 
 
626 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  31.84 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1449  YhhN family protein  32.08 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>