61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4581 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  100 
 
 		 214 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  64.93 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  58.46 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  57 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  57.95 
 
 		 220 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  32.46 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  38.71 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  39.63 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  41.99 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  39.77 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  36.21 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  39.23 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  33.69 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  30.77 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  37.5 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  37.64 
 
 		 261 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  37.5 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  38.67 
 
 		 254 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  36.97 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  40.28 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  40.28 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  40.28 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  28.43 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  27.64 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  32.93 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  35.76 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  35.76 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  33.94 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  38.46 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  33.33 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  34.15 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  36.17 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0951  YhhN family protein  27.54 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  40.29 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  33.33 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  35.53 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  33.53 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  35.06 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  35.71 
 
 		 597 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  35.06 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  35.06 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  35.06 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  35.06 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  35.06 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  34.06 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1642  YhhN family protein  27.45 
 
 		 371 aa  45.4  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.450211  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  35.22 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  35.71 
 
 		 597 aa  45.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1057  hypothetical protein  32.59 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  33.12 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0399  YhhN family protein  28.48 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3844  hypothetical protein  30.46 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3887  hypothetical protein  30.46 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3767  hypothetical protein  30.46 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3777  hypothetical protein  30.46 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3946  hypothetical protein  30.46 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  31.76 
 
 		 218 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0526  hypothetical protein  29.45 
 
 		 226 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0527  hypothetical protein  29.45 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2687  YhhN family protein  32.63 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>