45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2378 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  100 
 
 		 252 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  100 
 
 		 252 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  99.53 
 
 		 215 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  78.18 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  79.09 
 
 		 244 aa  278  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  60.24 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  52.11 
 
 		 254 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  52.83 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  48.29 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  51.64 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  47.75 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  39.04 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  39.51 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  36.56 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  37.65 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  36.09 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  36.09 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  44.1 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  44.1 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  44.1 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  44.1 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  44.1 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  44.1 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  44.1 
 
 		 216 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  43.55 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  37.34 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  32.76 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  31.33 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  34.16 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  35.29 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  37.41 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  36.69 
 
 		 231 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  38.19 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  31.82 
 
 		 221 aa  53.1  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  37.7 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  31.21 
 
 		 626 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  30.28 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  33.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  27.85 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  28.48 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  30.87 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  26.79 
 
 		 225 aa  45.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  33.56 
 
 		 217 aa  45.4  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  33.99 
 
 		 202 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>