18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1943 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  100 
 
 		 217 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  35.58 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  40.46 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  32.96 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  37.57 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  32.64 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  32.7 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  34.62 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  34.62 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  35.07 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  29.22 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  29.01 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  30.12 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  33.56 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  33.55 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2687  YhhN family protein  32.3 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  33.55 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  32.59 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>