27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5175 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5175  YhhN family protein  100 
 
 		 225 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  32.35 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  37.06 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  36.47 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  34.71 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  38.36 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  34.12 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  34.71 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  34.71 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  29.94 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  30.22 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2687  YhhN family protein  30.2 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0177327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  27.89 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  29.9 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  26.4 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  26.04 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  28.06 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  27.55 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  33.54 
 
 		 626 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  28.48 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  28.31 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  26.8 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  25.84 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  27.98 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  29.01 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2729  hypothetical protein  28.48 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000838492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>