29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3751 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0247  YhhN family protein  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03270  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4788  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3854  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.85502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3751  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0248  YhhN family protein  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3950  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3667  hypothetical protein  99.52 
 
 		 208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03317  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3844  hypothetical protein  91.35 
 
 		 208 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3887  hypothetical protein  91.35 
 
 		 208 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3767  hypothetical protein  91.35 
 
 		 208 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3777  hypothetical protein  91.35 
 
 		 208 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3946  hypothetical protein  91.35 
 
 		 208 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3872  YhhN family protein  86.06 
 
 		 208 aa  359  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0212  YhhN family protein  68.27 
 
 		 208 aa  231  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0089  YhhN family protein  61.54 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0572  hypothetical protein  66.83 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3984  YhhN family protein  66.83 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0234  hypothetical protein  66.35 
 
 		 208 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.674365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0094  YhhN family protein  61.54 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3881  YhhN family protein  54.07 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  26.11 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002133  hypothetical protein  29.13 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00285  hypothetical protein  26.83 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2377  hypothetical protein  26.57 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549446  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  22.38 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  31.19 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  27.09 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>