28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0212 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0212  YhhN family protein  100 
 
 
208 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3872  YhhN family protein  68.27 
 
 
208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3946  hypothetical protein  67.31 
 
 
208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3777  hypothetical protein  67.31 
 
 
208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3767  hypothetical protein  67.31 
 
 
208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3887  hypothetical protein  67.31 
 
 
208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3844  hypothetical protein  67.31 
 
 
208 aa  271  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996869  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0234  hypothetical protein  80.77 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.674365  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0572  hypothetical protein  80.77 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3984  YhhN family protein  80.77 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0089  YhhN family protein  63.94 
 
 
209 aa  245  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3881  YhhN family protein  57.89 
 
 
209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0247  YhhN family protein  68.27 
 
 
208 aa  238  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03270  hypothetical protein  68.27 
 
 
208 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4788  hypothetical protein  68.27 
 
 
208 aa  238  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3854  hypothetical protein  68.27 
 
 
208 aa  238  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.85502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3751  hypothetical protein  68.27 
 
 
208 aa  238  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0248  YhhN family protein  68.27 
 
 
208 aa  238  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3950  hypothetical protein  68.27 
 
 
208 aa  238  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03317  conserved inner membrane protein  68.27 
 
 
208 aa  238  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3667  hypothetical protein  67.79 
 
 
208 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0094  YhhN family protein  62.98 
 
 
209 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  32.28 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  23.56 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00285  hypothetical protein  28.78 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002133  hypothetical protein  28.5 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  27.66 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2377  hypothetical protein  22.12 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>