23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002133 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002133  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00285  hypothetical protein  84.95 
 
 		 206 aa  334  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2377  hypothetical protein  49.76 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549446  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  31.79 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0089  YhhN family protein  32.38 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0094  YhhN family protein  31.73 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3946  hypothetical protein  28.29 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3777  hypothetical protein  28.29 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3767  hypothetical protein  28.29 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3844  hypothetical protein  28.29 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3887  hypothetical protein  28.29 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3854  hypothetical protein  29.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.85502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03270  hypothetical protein  29.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4788  hypothetical protein  29.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03317  conserved inner membrane protein  29.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3751  hypothetical protein  29.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0248  YhhN family protein  29.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3950  hypothetical protein  29.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0247  YhhN family protein  29.13 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3872  YhhN family protein  25.85 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3667  hypothetical protein  28.64 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3881  YhhN family protein  27.18 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  25.15 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>