More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0142 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0142  stationary-phase survival protein SurE  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  35.55 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  35.16 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1760  stationary phase survival protein SurE  34.69 
 
 
253 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  34.29 
 
 
255 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  31.27 
 
 
269 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0353  stationary phase survival protein SurE  33.05 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  31.78 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2063  stationary phase survival protein SurE  32.82 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  30.92 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1272  stationary phase survival protein SurE  32.95 
 
 
265 aa  95.9  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  30.53 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0542  stationary phase survival protein SurE  31.68 
 
 
264 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  34.69 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1607  stationary phase survival protein SurE  32.06 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499978  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  31.35 
 
 
269 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2692  stationary-phase survival protein SurE  33.2 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00465836  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0374  stationary phase survival protein SurE  32.03 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  33.75 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1108  stationary-phase survival protein SurE  30.16 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3500  stationary-phase survival protein SurE  31.4 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0405  stationary-phase survival protein SurE  32.13 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  33.33 
 
 
257 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  31.12 
 
 
252 aa  92  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3836  stationary phase survival protein SurE  31.65 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0305  stationary phase survival protein SurE  32.06 
 
 
264 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.799636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1432  stationary phase survival protein SurE  34.17 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105613  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0660  stationary-phase survival protein SurE  32.81 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272098  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0285  5'-nucleotidase / exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase  28.45 
 
 
256 aa  89  7e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.443124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2160  stationary-phase survival protein SurE  34.84 
 
 
244 aa  88.6  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2524  stationary phase survival protein SurE  33.47 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000294011  normal  0.0686977 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0837  stationary phase survival protein SurE  33.52 
 
 
262 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.915903  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19351  stationary phase survival protein SurE  30.22 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.692347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3024  stationary phase survival protein SurE  34.45 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1431  stationary phase survival protein SurE  33.74 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3723  stationary phase survival protein SurE  30.2 
 
 
270 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00165  stationary phase survival protein SurE  32.24 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0838053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  29.18 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1904  stationary phase survival protein SurE  31.12 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  33.52 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  29.43 
 
 
269 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1385  stationary phase survival protein SurE  30.08 
 
 
263 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2978  stationary phase survival protein SurE  32.05 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201061  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0953  stationary phase survival protein SurE  30.86 
 
 
259 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  29.41 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3031  stationary-phase survival protein SurE  32.92 
 
 
277 aa  86.3  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.964874  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0988  stationary phase survival protein SurE  30.33 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00114073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1371  stationary phase survival protein SurE  33.05 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184616  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1041  stationary phase survival protein SurE  33.06 
 
 
248 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.820653 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0048  stationary phase survival protein SurE  29.46 
 
 
252 aa  85.9  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.764456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  35.68 
 
 
247 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1304  stationary-phase survival protein SurE  32.92 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2188  stationary phase survival protein SurE  30.65 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  31.35 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  31.4 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0130  stationary-phase survival protein SurE  31.87 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1802  stationary phase survival protein SurE  32.78 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508883  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1077  stationary-phase survival protein SurE  29.83 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.36785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0790  stationary phase survival protein SurE  34.44 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0993951  normal  0.0224447 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1816  stationary phase survival protein SurE  32.1 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00857806  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  31.15 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0400  stationary-phase survival protein SurE  29.52 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.207609  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  30.77 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  31.99 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1004  stationary phase survival protein SurE  31.36 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0723  stationary phase survival protein SurE  29.84 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000069288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  30.29 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  30.29 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1918  stationary phase survival protein SurE  31.15 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1192  stationary phase survival protein SurE  32.42 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000123803  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1190  stationary phase survival protein SurE  31.1 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  31.38 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1992  stationary phase survival protein SurE  31.15 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  31.89 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  31.84 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0329  stationary phase survival protein SurE  34.16 
 
 
258 aa  82  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1863  stationary phase survival protein SurE  34.16 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2311  3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase / exopolyphosphatase  34.13 
 
 
279 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4403  stationary phase survival protein SurE  31.69 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508997  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08830  stationary-phase survival protein SurE  30.61 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000859123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  30.6 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  30.6 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  30.6 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2098  stationary phase survival protein SurE  30.86 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  29.73 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  30.6 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  30.6 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0829  stationary phase survival protein SurE  29.12 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.200096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  30.6 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  30.6 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  33.33 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  30.6 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  30.6 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  30.29 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3133  stationary phase survival protein SurE  31.84 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0688864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0835  stationary phase survival protein SurE  32.78 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.153163  normal  0.263072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3237  stationary phase survival protein SurE  31.84 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0275  stationary phase survival protein SurE  30.08 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.608468  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3117  stationary phase survival protein SurE  31.84 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>