40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3226 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  36.05 
 
 		 182 aa  91.3  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  37.72 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  42.48 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  67.44 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  64.29 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  41.54 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  47.37 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4844  type IV pilus assembly protein PilX  37.09 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  46.43 
 
 		 263 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  48.21 
 
 		 257 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 208 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  46 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  40 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  35.94 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  54.55 
 
 		 208 aa  47.8  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  30.67 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  43.4 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1704  PilX protein  38.57 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  35.82 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1766  fimbrial assembly protein  38.57 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.132281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0191  putative type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  26.11 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  42.11 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  31.46 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  38.33 
 
 		 253 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  35.09 
 
 		 244 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01323  PilX  44.23 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1127  type IV pilus assembly protein PilX  35.44 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3229  hypothetical protein  35.44 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1060  type IV pilus assembly protein PilX  35.44 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0018  putative Tfp pilus assembly protein  38.95 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1162  type IV pilus assembly protein PilX  35.44 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_002936  DET1355  hypothetical protein  39.73 
 
 		 375 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00651759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2555  hypothetical protein  33.93 
 
 		 229 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.193686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0736  hypothetical protein  34.43 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.539036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  31.37 
 
 		 541 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  31.37 
 
 		 541 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  31.37 
 
 		 541 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0088  hypothetical protein  36.17 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  31.58 
 
 		 254 aa  40.8  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>