14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5190 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  527  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  57.14 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  54.37 
 
 		 253 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3187  hypothetical protein  55.6 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.581492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2912  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  30.12 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.313444  normal  0.0143399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3104  hypothetical protein  33.46 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  27.35 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  25.81 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  28.98 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  24.9 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  26.79 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  27.66 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  32.56 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  29.63 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>