23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0725 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  39.91 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  35.85 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  36.65 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  27.46 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  28.28 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  27.78 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  28.98 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0780  signal peptide protein  29.59 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  29.61 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  29.61 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0667  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  25.23 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498495  normal  0.352723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2684  putative signal peptide protein  29.51 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0711  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  25.47 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291551  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  25.63 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0683  hypothetical protein  25.76 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  26.73 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  39.77 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3187  hypothetical protein  26.64 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.581492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  30.11 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  41.38 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  26.8 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  28.98 
 
 		 188 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>