25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2273 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 182 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  36.05 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  35.98 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  33.99 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  25.63 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  39.13 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  28.33 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  58.62 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  44.83 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  28 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  27.23 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  46.15 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  46.3 
 
 		 177 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0736  hypothetical protein  25.61 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.539036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  40.58 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  55.17 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0191  putative type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.78 
 
 		 198 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  39.13 
 
 		 257 aa  48.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  25.71 
 
 		 170 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  29.94 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  26.73 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0683  hypothetical protein  25.14 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4844  type IV pilus assembly protein PilX  28.39 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  39.22 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  39.53 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>