25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0492 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  100 
 
 		 208 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  42.86 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  31.32 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  38.58 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  26.74 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  43.02 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  27.1 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  38.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  37.5 
 
 		 257 aa  51.6  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  37.5 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  51.06 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2884  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  31.29 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  41.82 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  37.36 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  40.74 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  56.25 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  44.12 
 
 		 168 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  30.99 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  41.33 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  33.75 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  35.85 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0683  hypothetical protein  35.85 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0217  hypothetical protein  40.68 
 
 		 400 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.714135  normal  0.0525826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  29.25 
 
 		 189 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_003296  RS05334  putative type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  56.25 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.754794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>