15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5193 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  60.5 
 
 		 199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0959  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  35.24 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564691 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  39.13 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  35.38 
 
 		 547 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  34.38 
 
 		 542 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  35.38 
 
 		 547 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  35.38 
 
 		 547 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0217  hypothetical protein  43.75 
 
 		 400 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.714135  normal  0.0525826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  34.29 
 
 		 541 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  34.29 
 
 		 541 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  34.29 
 
 		 541 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2884  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  39.44 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  36.84 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  33.33 
 
 		 263 aa  41.2  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>