23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2824 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  100 
 
 		 221 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  50.24 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  47.31 
 
 		 215 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  35.85 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  28.28 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  28.68 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  26.64 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  26.45 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  27.35 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0780  signal peptide protein  28.66 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0711  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  24.41 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291551  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  27.23 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3187  hypothetical protein  28.51 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.581492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2684  putative signal peptide protein  28.31 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0667  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  24.53 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498495  normal  0.352723 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  43.94 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  40.91 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0786  type IV pilus assembly protein PilX  31.19 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.568119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  32 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  28.02 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  39.58 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  26.67 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  36.84 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>