13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2538 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3187  hypothetical protein  81.42 
 
 		 256 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.581492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  59.75 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  54.37 
 
 		 254 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2912  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  33.08 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.313444  normal  0.0143399 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  27.46 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  26.45 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  25.62 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  24.06 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  31.58 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  30.09 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3104  hypothetical protein  30.38 
 
 		 228 aa  45.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  28.09 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>