23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2662 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  100 
 
 		 208 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  50.24 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  44.94 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  39.91 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0711  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  28.16 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291551  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0780  signal peptide protein  33.93 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  26.03 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0667  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  28.43 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498495  normal  0.352723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2684  putative signal peptide protein  34.5 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  26.95 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  25.83 
 
 		 257 aa  68.2  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  32.67 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  30.81 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  25.81 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  25.62 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0719  signal peptide protein  29.52 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  28 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3187  hypothetical protein  26.52 
 
 		 256 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.581492  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0683  hypothetical protein  26.2 
 
 		 170 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  25.67 
 
 		 170 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  30.77 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  28.21 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  44.16 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>