10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2684 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2684  putative signal peptide protein  100 
 
 		 186 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0780  signal peptide protein  46.91 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  32.65 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0711  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  32.06 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291551  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0667  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  32.21 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498495  normal  0.352723 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  29.19 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  30.68 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  25.63 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0719  signal peptide protein  34.29 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  26.53 
 
 		 263 aa  48.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>