18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3552 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  100 
 
 		 215 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  49.05 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  45 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  37.62 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  28 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  29.58 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0780  signal peptide protein  30 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  28.11 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2684  putative signal peptide protein  29.83 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.255426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  28.51 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  27.35 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  25.25 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0711  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  26.73 
 
 		 263 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291551  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0667  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  26.57 
 
 		 263 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498495  normal  0.352723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3187  hypothetical protein  28.24 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.581492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  29.36 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0786  type IV pilus assembly protein PilX  30.29 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.568119  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  39.13 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>