17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0786 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0786  type IV pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.568119  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  30.37 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  27.89 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  41.03 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  30.08 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  28.3 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  28.43 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  40.35 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  42.03 
 
 		 253 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  41.07 
 
 		 263 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  31 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  30.29 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  40.43 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  47.73 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  42.59 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  25.32 
 
 		 213 aa  42  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  27.67 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>