26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0716 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  92.7 
 
 		 189 aa  297  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  32.67 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  27.73 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  30.43 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  33.99 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  29.44 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  26.25 
 
 		 257 aa  62  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  27.66 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0683  hypothetical protein  27.17 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  26.67 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  27.12 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  29.46 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  26.55 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  30.82 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  41.82 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  50.91 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  31.46 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  25.63 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  28.1 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  28.9 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3187  hypothetical protein  29.18 
 
 		 256 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.581492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2912  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  28.11 
 
 		 265 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.313444  normal  0.0143399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  29.65 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0736  hypothetical protein  41.82 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.539036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  32.96 
 
 		 164 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>