28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2156 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 178 aa  356  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  35.98 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  29.61 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  35.56 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  37.72 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  35.03 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  28.24 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  28.21 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0683  hypothetical protein  27.65 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  33.11 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  39.67 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  28.92 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  50 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  24.19 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  27.27 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  43.55 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  32.32 
 
 		 257 aa  50.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  41.27 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  35.23 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  38.57 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  28.15 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1704  PilX protein  35.16 
 
 		 164 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4844  type IV pilus assembly protein PilX  31.51 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0736  hypothetical protein  26.14 
 
 		 163 aa  44.3  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.539036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1766  fimbrial assembly protein  35.23 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.132281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01323  PilX  41.18 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0786  type IV pilus assembly protein PilX  29.31 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.568119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  51.43 
 
 		 168 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>