16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4844 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4844  type IV pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 159 aa  314  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  58 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  58 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  30.46 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4552  hypothetical protein  33.62 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  37.09 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0650  hypothetical protein  29.37 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0610  hypothetical protein  27.78 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0656  hypothetical protein  29.31 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.780168  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  49.02 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  40.35 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01323  PilX  43.75 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  33.13 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  46 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  36.67 
 
 		 199 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  31.11 
 
 		 195 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>