17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0656 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0656  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  296  7e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.780168  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0650  hypothetical protein  72.08 
 
 		 154 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0610  hypothetical protein  69.23 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4552  hypothetical protein  63.06 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  39.46 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  35.57 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  35.11 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4844  type IV pilus assembly protein PilX  30.2 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  29.73 
 
 		 195 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  24.09 
 
 		 547 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  24.09 
 
 		 547 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  24.09 
 
 		 547 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  34.72 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  34.33 
 
 		 541 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  34.33 
 
 		 541 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  34.33 
 
 		 541 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  35 
 
 		 542 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>