21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0850 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  87.82 
 
 		 541 aa  970    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  87.64 
 
 		 541 aa  968    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  88.19 
 
 		 541 aa  973    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1088    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  75.42 
 
 		 547 aa  805    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  75.8 
 
 		 547 aa  807    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  74.95 
 
 		 547 aa  807    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0488  hypothetical protein  30.09 
 
 		 595 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3248  hypothetical protein  31.65 
 
 		 749 aa  82.8  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0588  hypothetical protein  34.59 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3249  ferredoxin-type 4Fe-4S protein  39.74 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3251  hypothetical protein  27.82 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1168  hypothetical protein  31.91 
 
 		 535 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000338543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1138  hypothetical protein  30.3 
 
 		 538 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000071313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3250  hypothetical protein  43.48 
 
 		 477 aa  50.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1198  hypothetical protein  27.52 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000167019  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1184  hypothetical protein  29.55 
 
 		 639 aa  47.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  34.38 
 
 		 195 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1043  hypothetical protein  25 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0650  hypothetical protein  28.47 
 
 		 472 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.630777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3312  putative lipoprotein  25.61 
 
 		 412 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0728256  normal  0.382581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>