13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0610 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0610  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  311  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0650  hypothetical protein  92.37 
 
 		 154 aa  253  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0656  hypothetical protein  69.05 
 
 		 147 aa  176  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.780168  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4552  hypothetical protein  66.88 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4844  type IV pilus assembly protein PilX  27.78 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  30.87 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  32.21 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  32.43 
 
 		 195 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  29.17 
 
 		 182 aa  43.9  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  34.25 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  41.18 
 
 		 547 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  41.18 
 
 		 547 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  41.18 
 
 		 547 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>