17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0650 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0650  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0610  hypothetical protein  92.37 
 
 		 154 aa  253  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4552  hypothetical protein  68.15 
 
 		 157 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0656  hypothetical protein  72.08 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.780168  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  35.57 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4844  type IV pilus assembly protein PilX  29.37 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  34.01 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  33.71 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  37.5 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  33.78 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  50 
 
 		 547 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  29.06 
 
 		 541 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  43.14 
 
 		 547 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  43.14 
 
 		 547 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  29.06 
 
 		 541 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  29.06 
 
 		 541 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  29.06 
 
 		 542 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>