20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3316 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0706  hypothetical protein  99.45 
 
 		 541 aa  1078    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3316  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1082    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3428  hypothetical protein  97.04 
 
 		 541 aa  1056    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0850  hypothetical protein  87.64 
 
 		 542 aa  954    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  75.19 
 
 		 547 aa  803    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  75.38 
 
 		 547 aa  802    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0826  hypothetical protein  74.81 
 
 		 547 aa  801    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0488  hypothetical protein  29.58 
 
 		 595 aa  180  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3248  hypothetical protein  30.56 
 
 		 749 aa  78.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0588  hypothetical protein  29.49 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3249  ferredoxin-type 4Fe-4S protein  38.71 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1138  hypothetical protein  32.92 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000071313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1168  hypothetical protein  32.92 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000338543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3251  hypothetical protein  25.58 
 
 		 474 aa  51.2  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3250  hypothetical protein  41.3 
 
 		 477 aa  51.2  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0650  hypothetical protein  27.39 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.630777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1043  hypothetical protein  26.25 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  34.29 
 
 		 195 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1198  hypothetical protein  26.8 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000167019  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1184  hypothetical protein  29.71 
 
 		 639 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>