25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0718 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 164 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  82.74 
 
 		 168 aa  240  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4844  type IV pilus assembly protein PilX  58 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  39.53 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0656  hypothetical protein  39.46 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.780168  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4552  hypothetical protein  38.1 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  54.35 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0650  hypothetical protein  34.01 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.389747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  47.92 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  42.11 
 
 		 199 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  30.51 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01323  PilX  46.15 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  35.14 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  47.54 
 
 		 195 aa  47.4  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  38.6 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  32.43 
 
 		 257 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2884  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  34.15 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0610  hypothetical protein  32.21 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  30.97 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  49.15 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  45.9 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  34.94 
 
 		 263 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  34.43 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  32.96 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  36.67 
 
 		 208 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>