31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0211 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 165 aa  331  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  36.63 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  35.56 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  42.86 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  50 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  38.98 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  48.61 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  33.15 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  34.48 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  48.28 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  44.26 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2884  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  29.41 
 
 		 185 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  24.62 
 
 		 208 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  61.11 
 
 		 195 aa  51.2  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  26.29 
 
 		 221 aa  50.8  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1704  PilX protein  40 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1766  fimbrial assembly protein  37.31 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.132281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  29.61 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  36.51 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  36.92 
 
 		 257 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0683  hypothetical protein  24.55 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0814  hypothetical protein  29.46 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  26.47 
 
 		 253 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  47.37 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01323  PilX  31.65 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2836  putative transmembrane protein  41.07 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.223898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0849  hypothetical protein  34.43 
 
 		 547 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0861  hypothetical protein  34.43 
 
 		 547 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0018  putative Tfp pilus assembly protein  30.77 
 
 		 210 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>