13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1766 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1766  fimbrial assembly protein  100 
 
 		 164 aa  332  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.132281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1704  PilX protein  98.17 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01323  PilX  37.5 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1381  PilX protein  35.63 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  38.33 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  38.04 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  48.15 
 
 		 177 aa  50.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  36.92 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  34.07 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  35.48 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  41.3 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  44.07 
 
 		 195 aa  41.2  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  34.48 
 
 		 213 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>