25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0673 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  89.89 
 
 		 188 aa  315  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  30.88 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  26.47 
 
 		 263 aa  68.2  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  27.66 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  29.51 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2156  Tfp pilus assembly protein PilX  32.68 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000607311  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  29.73 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  27.97 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  27.85 
 
 		 244 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0683  hypothetical protein  28.49 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  27.91 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  25.83 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  27.18 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  26.63 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  52.73 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  41.38 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  31.89 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  50.91 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  28.03 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2912  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  27.71 
 
 		 265 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.313444  normal  0.0143399 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0018  putative Tfp pilus assembly protein  28.66 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3187  hypothetical protein  28.63 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.581492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  28.37 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  30.06 
 
 		 208 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>