14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3187 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3187  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.581492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2538  hypothetical protein  81.42 
 
 		 253 aa  417  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5196  hypothetical protein  61.29 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.7775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5190  hypothetical protein  55.6 
 
 		 254 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2912  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  33.83 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.313444  normal  0.0143399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  26.52 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  28.51 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  27.08 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  34.29 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  34.29 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3104  hypothetical protein  30.94 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  29.18 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3552  putative transmembrane protein  28.99 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  25.49 
 
 		 189 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>