12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05334 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05334  putative type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  100 
 
 		 193 aa  386  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.754794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0191  putative type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  58.73 
 
 		 198 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.470108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  26.09 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  29.02 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  35.44 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  30.18 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  45.28 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  39.73 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  41.86 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  33.33 
 
 		 199 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0683  hypothetical protein  24.29 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  41.86 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>