38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1381 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  38.11 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  29.5 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  30.04 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  30.38 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  30.77 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  30.57 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  31.6 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  28.8 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  28 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  26.84 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  33.61 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  26.36 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  26.36 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  30.8 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  27.78 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  28.19 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  26.24 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  29.33 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  26.18 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  26.18 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  23.86 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0036  hypothetical protein  24.31 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  23.89 
 
 		 729 aa  47.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  25 
 
 		 719 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  27.45 
 
 		 807 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  25.66 
 
 		 717 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  23.51 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  23.51 
 
 		 412 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  23.51 
 
 		 386 aa  42.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  23.51 
 
 		 412 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  23.51 
 
 		 412 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  26.13 
 
 		 580 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  26.36 
 
 		 547 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  23.51 
 
 		 412 aa  42.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  23.51 
 
 		 412 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  23.51 
 
 		 412 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  25.66 
 
 		 787 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>