22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3686 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  100 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  93.85 
 
 		 244 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  93.44 
 
 		 267 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  89.34 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  63.71 
 
 		 250 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  61.57 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  61.32 
 
 		 248 aa  289  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  49.44 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  48.12 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  48.09 
 
 		 273 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  38.93 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  29.96 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  29.96 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  30.37 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  30.47 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  28.33 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  28.98 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  25.2 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  25.46 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  22.18 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  23.05 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>