20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0635 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  508  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  99.21 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  25.7 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  25.3 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  26.18 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  28.97 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  25 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  28.33 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  25.22 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  25.31 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  20.79 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  28.84 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  25.74 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  22.1 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  23.62 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  23.67 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  22.4 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  23.72 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  23.16 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  23.16 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>