25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3388 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  90.16 
 
 		 267 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  90.57 
 
 		 244 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  89.34 
 
 		 256 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  62.18 
 
 		 250 aa  300  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  59.92 
 
 		 247 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  60.49 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  48.33 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  47.78 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  47.86 
 
 		 273 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  37.74 
 
 		 278 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  29.96 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  29.96 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  29.69 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  28.46 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  28.22 
 
 		 264 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  28.94 
 
 		 287 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  25.51 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  25.7 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  25.09 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  20.85 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0036  hypothetical protein  24.5 
 
 		 306 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0639  type II and III secretion system protein  32.84 
 
 		 596 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  21.09 
 
 		 264 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  34.38 
 
 		 673 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>