23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2406 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  68.89 
 
 		 273 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  70.16 
 
 		 273 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  54.09 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  50.92 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  49.44 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  49.44 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  47.76 
 
 		 278 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  49.44 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  49.27 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  48.58 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  32.22 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  32.22 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  33.69 
 
 		 282 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  30.52 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  27.18 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  30.29 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  28.83 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  28.03 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  24 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  26.1 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  25.63 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  25.49 
 
 		 894 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>