23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  48.52 
 
 		 273 aa  261  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  49.61 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  49.2 
 
 		 269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  41.47 
 
 		 247 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  40.6 
 
 		 248 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  40.16 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  37.73 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  37.79 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  38.93 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  36.73 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  33.73 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  31.91 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  29.74 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  27.04 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  27.04 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  28.19 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  27.92 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  27.61 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  26.86 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  25.31 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  24.69 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  26.28 
 
 		 694 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>