23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4115 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  100 
 
 		 267 aa  546  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  99.59 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  93.44 
 
 		 256 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  90.16 
 
 		 244 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  61.18 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  59.5 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  60 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  50.19 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  47.74 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  47.86 
 
 		 273 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  37.73 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  28.95 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  28.95 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  29.5 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  29.05 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  29.46 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  29.3 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  25.51 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  25.3 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  24.16 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  22.61 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  21.4 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0036  hypothetical protein  26.4 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>