23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2574 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  95.77 
 
 
273 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  70.56 
 
 
269 aa  362  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  56.13 
 
 
250 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  52.03 
 
 
248 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  52.4 
 
 
247 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  48.52 
 
 
278 aa  261  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  47.74 
 
 
267 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  47.74 
 
 
244 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  48.12 
 
 
256 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  47.37 
 
 
244 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  28.52 
 
 
264 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  28.52 
 
 
264 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  32.13 
 
 
282 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  28.57 
 
 
264 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  28 
 
 
293 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  27.03 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  29 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  28.33 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  23.27 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  25.18 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1356  hypothetical protein  23.4 
 
 
263 aa  49.7  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0036  hypothetical protein  23.36 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>