26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2107 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2107  NolW-like  100 
 
 		 287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3070  hypothetical protein  32.29 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.767315  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1381  hypothetical protein  30.38 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2854  hypothetical protein  29.89 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.745379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28410  secretion system protein  29.74 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4115  NolW domain protein  29.3 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1749  NolW domain-containing protein  29.3 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.171025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3686  NolW domain-containing protein  29.08 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.653895  normal  0.0806622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0839  NolW-like protein  23.72 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000399566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0983  NolW-like protein  23.72 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000059793  normal  0.823572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3363  type II and III secretion system family protein  26.43 
 
 		 248 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00438099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3388  NolW domain-containing protein  28.94 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.983519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1809  hypothetical protein  25.88 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.421522  hitchhiker  0.00000000151878 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3195  NolW-like  25 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.392676  decreased coverage  0.00831226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3601  NolW-like  27.2 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2406  NolW domain-containing protein  28.27 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.138617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2574  hypothetical protein  27.03 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0635  hypothetical protein  20.79 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0619  hypothetical protein  20.79 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3490  NolW domain-containing protein  23.45 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0036  hypothetical protein  24.9 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  26.94 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  27.27 
 
 		 433 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1112  competence protein E  25.93 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003452  putative maturation protein  23.67 
 
 		 353 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.171199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>